Является ли это главным WHM или просто учетной записью посредника, если это только учетная запись посредника, вы не сможете изменить php.ini - обычно в этом случае вы вносите изменения через файл .htaccess для каждого сайта,или поместите php.ini в каталог сайта, где вы хотите применить изменения.
Если это учетная запись главного сервера, вы можете также изменить php.ini, расположенный в / usr / local / lib / php.ini через ssh, затем перезапустите httpd, чтобы обновить его.