У меня тоже была эта проблема. Затем я понял, что, поскольку проект C ++ / clr является инфраструктурным проектом, к которому я редко обращаюсь, я могу просто выгрузить его в проект, убедившись, что он правильно встроен во все необходимые конфигурации.
После выгрузки проекта и перестройки решения для дополнительной безопасности кажется, что ReSharper «не знал» об указанном проекте, а использовал только его сборку, и проблема больше не возникала.