Я рекомендую эти три строки
log_slow_queries
set-variable = long_query_time=1
log-queries-not-using-indexes
Первый и второй будут регистрировать любой запрос в течение секунды. Как отмечали другие, один-секундный запрос довольно далеко, если вы стремитесь к высокой скорости транзакций на своем сайте, но я обнаружил, что он вызывает некоторые реальные WTF; запросы, которые должны быть быстрыми, но для какой-либо комбинации данных, с которыми они были выполнены, не было.
Последний будет регистрировать любой запрос, который не использует индекс. Если вы не используете хранилище данных для какого-либо общего запроса, у вас должен быть лучший индекс, который вы можете найти, поэтому обратите внимание на его вывод.
Хотя это, конечно, не для производства, этот последний вариант
log = /var/log/mysql/mysql.log
будет регистрировать все запросы, которые могут быть полезны, если вы пытаетесь настроить конкретную страницу или действие.