Это довольно просто, на самом деле - я попытаюсь проиллюстрировать:
<target name="run-command">
<exec program="ConsoleTest.exe" basedir="${test.dir}">
<arg value="-cp" />
</exec>
</target>
Basedir является необязательным, оно указывает, откуда запустить программу. Но если ваша программа находится на пути (например, ping), вам, вероятно, не нужно беспокоиться об этом.
Ознакомьтесь также с официальной документацией :)