У меня была такая же ошибка.
Это, безусловно, было связано с наличием более ранних версий Fiddler и некоторой несовместимостью между ними.
Вышеуказанная папка используется только Fiddler, где она хранит созданные им сертификаты (или, по крайней мере, для личных сертификатов на вашем ящике, и Fiddler, безусловно, единственный, кто ее использует). Вы можете проверить, есть ли у вас другие личные сертификаты, чем Fiddler. В IE это использует Сервис / Свойства обозревателя / Контент / Сертификаты / Личные.
Полностью очистите папку и не бойтесь сообщения об удалении системных файлов.
Затем в Fiddler снова выберите параметры захвата и расшифруйте трафик HTTPS.
При необходимости повторно экспортируйте корневой сертификат Fiddler на рабочем столе, а затем импортируйте его в IE и FF.
При необходимости перезапустите браузер и наслаждайтесь.
Полагаю, вместо удаления всего этого удаления только в IE закрытый сертификат, выданный DO_NOT_TRUST_FIddlerRoot, делает то же самое, но я не проверял это.
Не забудьте отключить опцию дешифрования, как только она вам больше не понадобится.