Вы должны использовать:
git add <file>
для добавления файла в поэтапные изменения,
или
git checkout -- <file>
, чтобы вернуть его к тому, что в данный момент ставится.
Это объясняется в сообщении git status
:
# Changed but not updated:
# (use "git add <file>..." to update what will be committed)
# (use "git checkout -- <file>..." to discard changes in working directory)
Или, если вы хотите выбросить все свои изменения (включая поэтапные изменения), используйте:
git reset --hard HEAD