Программное обеспечение вашего веб-сервера определяет интерфейс для взаимодействия с внешними сценариями. Наиболее распространенным из них является Common Gateway Interface (CGI). Не зная больше о настройке вашего сервера, мы не можем сказать ничего более конкретного.
Если вы используете Apache, взгляните на http://httpd.apache.org/docs/2.0/howto/cgi.html, в котором рассказывается, как настроить CGI.
Существуют и другие подходы к этому, и все они тесно связаны с конкретным серверным программным обеспечением, которое вы используете.