У вас возникнет проблема, если вы захотите использовать LocalDB в вашем приложении .NET Framework 4.5. Строка соединения, которую вам нужно использовать, это труба первая:
Server=np:\\.\pipe\LOCALDB#F365A78E\tsql\query;
Это потому, что .NHibernate скомпилирован с .NET 4.0 Framework, а не .NET 4.5.
Для справки см. Строку ниже в NHibernate.csporj из репозитория NHibernate Github
<TargetFrameworkVersion>v4.0</TargetFrameworkVersion>