Если вы хотите на самом деле редактировать сам PE-файл, для того, чтобы Olly сделал свое дело, вам нужно будет дополнить его инструментом, который может запустить процесс и восстановить PE-файл, например LordPE. LordPE может добавить разделы для вас, он делает это для своих собственных целей.
Для редактирования бинарного файла для добавления разделов вы также можете попробовать инструмент "Stud PE", он может добавлять разделы для вас, но вам придется поработать с самим файлом, чтобы получить байты сборки, в которые вы хотите добавить бинарный
Самый простой способ сделать это вручную - это увеличить размер последнего раздела в двоичном файле (поле SizeOfRawData раздела в заголовке PE), увеличить поле SizeOfImage заголовка PE и сбросить байты в конце файл. Вам также может потребоваться установить исполняемый флаг для последнего раздела (в заголовке PE).