Я посмотрел на источник, похоже, вы можете передать флаг opt_nodraw методу addMarker. Не уверен, что это то, что вы ищете
/**
* Add an array of markers to the clusterer.
*
* @param {Array.<google.maps.Marker>} markers The markers to add.
* @param {boolean=} opt_nodraw Whether to redraw the clusters.
*/
MarkerClusterer.prototype.addMarkers = function(markers, opt_nodraw) {
for (var i = 0, marker; marker = markers[i]; i++) {
this.pushMarkerTo_(marker);
}
if (!opt_nodraw) {
this.redraw();
}
};