Если вы только начинаете с MATLAB, я настоятельно рекомендую вместо этого пойти по пути Python (если нет какой-то очень конкретной причины, по которой вы должны использовать MATLAB). Основы (например, операции с массивами и матрицами) очень похожи на MATLAB.
В моей текущей области работы (нейробиология) существует значительный переход от MATLAB к Python. Многие группы делают это, потому что Python бесплатный и, как правило, более мощный.
Базовые пакеты, которые вам, вероятно, понадобятся для запуска, будут: numpy (числовые значения базового массива), scipy (больше алгоритмов) и matplotlib (прорисовка) , Поскольку вы хотите работать в командной строке, я предлагаю также IPython .
Как уже упоминалось в другом ответе, существуют также некоторые дистрибутивы Python, которые включают в себя множество пакетов, например PythonXY , Enthought Python Distribution или Anaconda .
В Интернете доступно множество учебных пособий, найдите немного и выберите понравившийся.