Правильный синтаксис такой:
data _null_;
call missing(VAR1, VAR2);
run;
Подпрограмма вызова MISSING принимает имена переменных в качестве параметров, а не символьные константы , содержащие имена переменных. Doh!
Отвечая на мой собственный вопрос, чтобы импортировать это сообщение об ошибке в Интернет, так как ранее я не мог найти на него никакой ссылки.