Ух ты, ответ был довольно прост.После некоторых поисков в Google я наткнулся на это:
http://friendlybit.com/css/cross-browser-strategies-for-css/
В верхней части всех моих страниц у меня есть комментарий, содержащий контактную информацию и информацию об авторских правах.По-видимому, когда IE переходит к чтению страницы, он не находит Doctype, потому что он не в нужном месте, поэтому IE запускает Quirk Mode .Перемещение замедления Doctype в верхнюю часть всех страниц (выше моего комментария) решило проблему полностью!