Я новичок в JAGS и пытаюсь понять, как dinterval () работает в JAGS для цензурированных данных. Я моделирую грубые данные, где у меня есть только верхняя и нижняя границы для каждой точки данных (не истинное значение). Вот простой пример того, как я думаю, что это должно работать:
Некоторые верхние и нижние границы для каждой точки:
> head(lim)
L U
[1,] 14.98266 15.68029
[2,] 21.21827 21.91590
[3,] 18.34953 19.04716
[4,] 19.00186 19.69949
[5,] 15.39891 16.09654
[6,] 17.81705 18.51468
Функция для записи модели (при условии, что данные получены из нормали с общим средним и дисперсией):
playmodel <- function(){
for (i in 1:50){
is.censored[i] ~ dinterval(t[i], lim[i,])
t[i] ~ dnorm(mu,tau)
}
mu ~ dnorm(0,.001)
tau ~ dgamma(.01,.01)
}
filename <- "toymod.bug"
write.model(toymod,filename)
Некоторые функции и назначения для вызова jags:
data <- list("lim"=lim)
inits <- list(mu=rnorm(1),tau=rgamma(1,.01,.01),t=as.vector(apply(lim,1,mean)))
#last part is to ensure the starting value is between the upper and lower limit
#each chain will start at the same place for t but this is just for this case
params <- c("mu","tau")
И запустить модель:
playmodel.jags <- jags(data,inits, params, model.file="toymod.bug", n.chains=3,
n.iter=50000,n.burnin=30000, n.thin=1, DIC=TRUE,
working.directory=NULL,refresh = 50000/50, progress.bar = "text")
Что происходит, когда я запускаю это?
1) моя оценка мю колеблется прямо около 0, когда она должна быть 15
2) он не будет работать, если DIC = TRUE:
ошибка: "Ошибка в jags.samples (model, variable.names, n.iter, thin, type =" trace ",:
Не удалось настроить монитор трассировки для отклонения узла
Я уверен, что я делаю что-то глупое, и был бы признателен, если бы кто-то мог помочь поставить меня на правильный путь.