Используйте свойство Arguments
.
p.StartInfo.FileName = Directory.GetCurrentDirectory() + "\\timesync\\NistClock.exe";
p.StartInfo.Arguments = "sync";
Кстати, будьте осторожны с использованием Directory.GetCurrentDirectory()
.Обратите внимание, что этот метод может возвращать что-то другое, если вы используете какие-либо файловые диалоги в приложении.Возможно, лучше использовать вместо этого что-то вроде Assembly.GetExecutingAssembly().Location
и проанализировать каталог оттуда.