NSString *string = @"11:00:30.1";;
NSDateFormatter *dateFormatter= [[[NSDateFormatter alloc] init] autorelease];
[dateFormatter setDateFormat:@"HH:mm:ss.SS"];
NSDate *date = [dateFormatter dateFromString:string];
NSTimeInterval seconds = [date timeIntervalSince1970];
Редактировать: Спасибо Йохану Колу за указание на NSDateFormatter.Обновлен код для простоты.