Matlab использует свои собственные библиотеки glibc, и из-за этого часто бывает большой беспорядок.
Чтобы решить эту проблему, вы должны сначала убедиться, что Matlab использует поддерживаемую версию gcc . Вы получаете предупреждение об этом при компиляции?
Если вы sudoer, вы также можете "заставить" matlab использовать стандартный glibc, выполнив что-то подобное (я сделал это, и он отлично работает):
cd /usr/local/MATLAB/R2011a/sys/os/glnxa64
sudo mkdir old
sudo mv libstdc++.so.6* old
sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6 libstdc++.so.6
Многие люди жалуются на то, что в Интернете существуют разные решения, если эти два не работают.