Если они являются отдельными установками (и могут сосуществовать), или вы хотите обнаружить другую архитектуру, используйте для разделения идентификаторы AppID.
Если установка одна или другая, используйте тот же AppID.
Обратите внимание, что, как правило, нет причин делать две отдельные установки, поскольку Inno может справиться с любыми архитектурными различиями, очень похожими на отдельные установки.