Команда sdist вызывает команду build, которая по умолчанию помещает файлы в подкаталог build. Вы, вероятно, хотите сохранить это (то есть не заботиться об этом), чтобы ускорить будущие сборки.
sdist затем помещает файлы дистрибутива в подкаталог dist по умолчанию. python setup.py sdist -d $TMP (или эквивалентную переменную окружения %something% для Windows) можно использовать для помещения файла во временный каталог, чтобы он был уничтожен при следующей загрузке.
Если вы действительно заботитесь о директории сборки, попробуйте следующее: python setup.py build -b $TMP sdist -d $TMP. sdist должен быть достаточно умен, чтобы найти файлы, созданные при сборке.
distutils docs: http://docs.python.org/distutils
Справка по команде: python setup.py build --help