Самый простой способ - захватить весь рабочий стол, а затем перечислить окна и их положения, чтобы вы создали область / маску, которая оставляет окна рассматриваемого процесса / приложения. Тогда применение маски к захваченному изображению даст вам запрошенный снимок.