Вы можете воспользоваться существующим хорошим Java-программным обеспечением, используя ваше PHP-приложение.
Три хороших примера, которые я могу вспомнить сейчас, это Lucene (индексация свободного текста), BIRT (бизнес-аналитика / диаграммы) и RapidMiner или Weka (анализ данных / ai / машинное обучение)