Я использую cygwin на Windows 7 . У меня есть папка с примерно 1200 файлами одного типа (нет подкаталогов). Я пытаюсь пройти через папку и выполнить определенное действие (это биоинформационное выравнивание) для каждого файла. Вот код, который я использую:
$ for file in Project/genomes_0208/*;
do ./bowtie-build $file ../bowtie-0.12.7/indexes/abc;
done
./bowtie - сборка - это операция, которую я хочу выполнить. Теперь он завершает операцию для всех файлов в папке, но в этом случае он записывает выходные данные в один и тот же файл abc .
Итак, в итоге у меня есть только 1 файл с последним выводом. Как я могу создать 1200 разных файлов, по одному на каждый вход? Неважно, как я называю выходные файлы, это может быть что угодно, если они явно разные.
Надеюсь, я успешно объяснил проблему, буду признателен за любую помощь в этом!