Firebug - твой друг для таких вещей.Если вы не используете Firebug, потратьте некоторое время на его изучение, поскольку это избавит вас от множества головных болей в будущем.
Что касается вашей проблемы, то текущий div, покрывающий ваш выпадающий список, имеет z-индекс 10Ваш выпадающий список, имеющий z-индекс 1000, содержится в родительском элементе div, для которого не установлен набор z-index.Исправление состоит в том, чтобы дать родительскому div z-индекс:
#header {z-index: 11}