построение графика матрицы отношений в питоне

Question

У меня есть интерфейс Python, использующий wxpython, который позволяет пользователю заполнить матрицу (0/1) и затем отобразить ее для них. Программа создает пустую матрицу, затем создает график networkx из этой матрицы, а затем использует matplotlib.pylab для отображения графика.

numpy является обязательным, потому что программа также делает другие вещи, такие как получение транзитивных, рефлексивных и симметричных замыканий ... что касается networkx, я могу использовать что-то еще, если вы порекомендуете что-то еще лучше для построения графиков матриц, и как для matplotlib Я ненавижу это, пожалуйста, если вы знаете какой-либо другой способ отображения графика, пожалуйста, совет.

matplotlib - источник моей проблемы, когда пользователи нажимают кнопку графика, мои программы читают матрицу, создают графики, и matplotlib отображает ее в новом окне (по умолчанию). Теперь, если пользователь возвращается к исходному окну и строит график другой матрицы, не закрывая сначала окно matplotlib, программа завершает работу.

также то, как нарисованы отношения "стрелки", на мой взгляд, непривлекательно.

Мне нужен лучший способ построения графика моей матрицы, или, по крайней мере, как способ принудительно закрыть окно myplotlib, я попробовал plt.close (), но это не сработало, окно останется открытым, и оба окна будут сказать (не отвечая) и я должен закончить процесс.

это часть кода, о которой идет речь:

import numpy as np
import networkx as nx
import matplotlib.pylab as plt

... ... ...

def graph(values)
    plt.close()      #with or without this it does not work
    matrix = np.matrix(values)
    graph = nx.DiGraph(matrix)
    nx.draw(graph)
    plt.show()
    return

Answer 1

Мне кажется, ваша главная жалоба заключается в том, как wx обрабатывает окна matplotlib. Можно встроить фигуру Matplotlib в ваше окно wx. Вот пример:

http://wiki.scipy.org/Matplotlib_figure_in_a_wx_panel (обновлено)

Это становится немного сложнее. По сути, вы должны скопировать код и заменить метод «DemoPlotPanel.draw ()». Вам нужно будет изменить свой код, чтобы указать ось для рисования. Это похоронено в документации networkx здесь:

http://networkx.lanl.gov/reference/drawing.html

Answer 2

Я просто использую пример документации Networkx:

try:  
    import matplotlib.pyplot as plt  
except:  
    raise  

import networkx as nx  

G=nx.star_graph(20)  
pos=nx.spring_layout(G)  
nx.draw(G,pos)  
plt.show() # display

Так что ваш оператор plt.close () в начале не имеет смысла, вы должны удалить его. Вы также должны вычислить координатыдля ваших узлов это делает предложение pos = nx.spring_layout (G).Вы вызываете определенный алгоритм компоновки и предоставляете свой граф G, в ответ вы получаете словарь для каждого узла координаты x и y.

Внимательно посмотрите на примеры по адресу: http://networkx.lanl.gov/gallery.html