Если вы просто «обновите», SVN удалит все файлы, которые были удалены в системе контроля версий. Однако файлы, созданные во время процесса сборки, могут все еще быть там и могут мешать новой сборке. Я не уверен, есть ли у SVN команда для их удаления, но я думаю, что вы могли бы сделать это с помощью небольшого сценария, SVN определенно может сказать вам, какие файлы находятся под контролем исходного кода, а какие нет.