Eclipse не поддерживает разработку Flex самостоятельно. Вам нужно будет приобрести Flash Builder, основанный на Eclipse. Он может быть использован как подключаемый модуль для существующей установки Eclipse или установлен как отдельное приложение. Не существует бесплатного решения для использования flex внутри eclipse, о котором я знаю.
Flash Builder имеет свои преимущества и недостатки по сравнению с Flash Develop. Попробуйте оба варианта и посмотрите, какой из них соответствует вашим требованиям.
Если у вас возникли проблемы с использованием Flex SDK для Flash Develop, отправьте новый вопрос с подробной информацией.