Чтобы подсчитать, сколько 1,2,3,4,5 есть в выходном массиве: если у вас есть ArrayList из целых чисел:
final int[] candidate = new int[count];
for(int i : output)
candidate[i]++;
в предположении, что "count" является наибольшим значением, котороевы можете найти в ArrayList.
Вместо этого, если у вас есть ArrayList строк, вы пишете
final int[] candidate = new int[count];
for(String i : output)
candidate[Integer.parseInt(i)]++;