Понял, ребята:)
Я сталкивался с этой проблемой с октября прошлого года, но, наконец, я понял, почему?
Вместо добавления модулей, как я добавил выше в своем вопросе, используйте следующий новый синтаксис модуля, созданный для IIS7 (godaddy использует IIS7 для хостинга Windows)
<configuration>
<system.webServer>
<modules>
<add name="Header" type="Contoso.ShoppingCart.Header"/>
</modules>
</system.webServer>
</configuration>
Поместите все свои модули здесь, и все готово! Это красиво и отлично работает!
И "@Jon Skeet" нет необходимости иметь пространство имен для модулей, даже без пространства имен вы можете заставить его работать!
Узнайте больше об этом теге здесь http://www.iis.net/ConfigReference/system.webServer/modules