То, как я делал это несколько раз в прошлом, - это генерирование файла Java в зависимости от флага. Если вы используете ant, то генерация кода очень проста. В противном случае вы можете использовать файл шаблона с заполнителем и выполнить некоторые сценарии оболочки или аналогичные для генерации файла.