Вы можете удалить их, подключив пару фильтров и возвращая пустые массивы или строки, а не новые классы или идентификаторы:
add_filter('nav_menu_css_class', 'my_css_attributes_filter', 100, 1);
add_filter('nav_menu_item_id', 'my_css_attributes_filter', 100, 1);
add_filter('page_css_class', 'my_css_attributes_filter', 100, 1);
function my_css_attributes_filter($var) {
return is_array($var) ? array() : '';
}
Если вы хотите сохранить определенные классы, выможет сделать что-то вроде этого:
function my_css_attributes_filter($var) {
return is_array($var) ? array_intersect($var, array('current-menu-item')) : '';
}