Я думаю, что проблема все еще существует. Если я выключаю валидатор CSS и очищаю проект, ошибки исчезают. С другой стороны, если я включу и добавлю несколько регулярных выражений, чтобы исключить некоторые ошибки, валидатор по-прежнему будет отображать «исключенные» ошибки даже после выполнения команды «чистый проект». Похоже, что регулярные выражения как-то опущены.
Кстати, я работаю с версией Aptana Studio 3, сборка: 3.1.1.201204131931