Используйте ADO.NET, -Получите объект подключения из сеанса NHibernate, -Создайте команду Db -Заведите вашу процедуру в тексте Dbcommand -Запустите команду
Примечание: NHibernate может поддерживать хранимые процессы, но это сложный процесс.на эту ссылку , поэтому выберите ADO.NET, который оптимален в вашем сценарии.