Для точного ответа вам нужно только сравнить генераторы BC из обоих проектов, однако зачем использовать конвертер, LuaJIT с открытым исходным кодом, а IIRC, как и LuaDec, преобразовать его в байт-код LuaJIT должно быть довольно просто.
Однако вы должны взглянуть на параметры командной строки самого LuaJIT командной строки, которые можно использовать для вывода списка байт-кода или C / h / obj /.o файлы байт-кода, оба из которых могут быть использованы для того, что вы хотите.