Ну, вам нужно придумать набор правил транслитерации (фактически, отображение кодов кириллических символов в коды символов латинского алфавита). Затем для заданного потока слов, закодированных в кириллице, просто примените сопоставление и создайте результирующий поток слов, закодированных в латинском алфавите.