Вы можете добавить тег runat="server"
в iframe:
<iframe src="..." id="myframe" runat="server"></iframe>
, а затем в своем коде вы можете получить к нему доступ к моему идентификатору и установить свойства:
myframe.Visible = False
Обратите внимание, что, установив для свойства Visible значение False, iframe вообще не будет отображаться в выходном HTML. Если вы хотите скрыть iframe только на клиенте, вы можете управлять его атрибутами или свойствами стиля.