Предложение: переименуйте оба файла.
Очевидное решение:
ren a.xml temp.xml
ren b.xml a.xml
ren temp.xml b.xml
Конечно, это не спасет вас от гонок с другими процессами, но я думаю, если вам нужно беспокоитьсячто ты не будешь задавать этот вопрос так, как у тебя ...