Вам не нужно держать свои миграции навсегда, вы можете удалить их, как только вы уверены, что они вам больше не нужны.Просто зайдите в каталог db/migrate/
и удалите миграции, которые старше, скажем, пары месяцев.
Пока все миграции, которые вы хотите удалить, были применены повсеместно (т.е. разработка и производство)тогда они вам больше не нужны (если вы не хотите вернуться назад).На самом деле, миграция не предназначена для того, чтобы быть постоянными файлами, она просто для того, чтобы доставить вас от А до Б, а затем они просто багаж.