Я успешно открыл подпроект Maven в IDEA.Естественно, он не включил интеграцию с Git автоматически.В меню VCS я выбрал «Включить интеграцию управления версиями» и выбрал «Git» из подменю.
Затем IDEA пожаловался, что в проекте нет папки .git, и предложил выбрать родительскую папку .git.Я сделал это, и все заработало как ожидалось.
Если у вас нет опции Git в меню VCS, это может быть ошибкой.Попробуйте отключить плагин SVN и посмотрите, поможет ли это (у меня нет плагина SVN в моей IDEA).