Почему у вас есть "реальные" изменения, смешанные с изменениями вкладки? Сохраните свою текущую работу, сделайте одну гигантскую зачистку, чтобы очистить пустое пространство, нажмите ее, а затем вернитесь к своему регулярному программированию. Конечно, вы столкнетесь с несколькими конфликтами слияния с чем угодно, над чем работали до исправления пробелов, но это неизбежно.