Это полностью зависит от конкретного программного обеспечения Wiki, которое вы используете. Способ, который я видел, заключается в том, чтобы разместить файл js где-то еще, а затем включить его с тегом script с атрибутом src.
Если они этого не разрешают, возможно, они разрешают использование ИФРАМЫ, которую вы можете установить на странице, содержащей скрипт. Используя второй метод, вы не сможете получить доступ к DOM страницы хоста.