Я предполагаю, что вы хотите выйти чисто. Если вам не нужно выходить чисто, используйте PostQuitMessage. Если это так, и это приложение с пользовательским интерфейсом, отправьте WM_CLOSE в главное окно.
Вы должны уточнить, на какие объекты ваше программное обеспечение "не будет реагировать во время", когда вы выходите, и почему оно перестает отвечать