My Netbeans - это версия из репозитория Ubuntu 12.04 Software Center (7.0). Я решил эту проблему, установив параметры «Сертифицированные плагины», «Распределение NetBeans» и «Портал плагинов», которые по умолчанию не были активированы. Вы можете найти это на
Инструменты -> Плагины -> Доступные плагины
Во вкладке «Настройки» (последняя).
Сделав это, перезагрузите «Доступные плагины» (которые были для меня пустыми), и через несколько секунд появится много категорий. Найдите Java Web и EE и установите их (я нашел только подключаемый модуль Java Web).