Это также может быть нехватка памяти. Недостаток памяти может вызвать блокировки, я вижу то же самое на моем сервере.
Из документов Apache:
Если вашему экземпляру Solr не хватает памяти, виртуальная машина Java иногда выдает ошибку Java OutOfMemoryError. Когда это произойдет, опасности повреждения данных не будет, и Solr попытается выполнить корректное восстановление. Однако любое добавление / удаление / фиксация во время выполнения ошибки вряд ли будет успешным. Другие побочные эффекты могут возникнуть. Например, если используется механизм блокировки SimpleFSLock (как в случае с Solr 1.2), несвоевременная ошибка OutOfMemoryError может привести к потере Solr своей блокировки индекса. Если это произойдет, дальнейшие попытки изменить индекс приведут к
SEVERE: исключение во время фиксации / оптимизации: java.io.IOException: время ожидания блокировки истекло: SimpleFSLock@/tmp/lucene-5d12dd782520964674beb001c4877b36-write.lock
См. http://wiki.apache.org/solr/SolrPerformanceFactors