В дополнение к использованию orthogonalCoordinateDecimal
в качестве упомянутого @ pe60t0, установите диапазон графика оси Y так, чтобы он охватывал как положительные, так и отрицательные значения. Например, чтобы сделать интервал по оси Y от -10 до 10,
plotSpace.yRange = [CPTPlotRange plotRangeWithLocation:CPTDecimalFromDouble(-10.0)
length:CPTDecimalFromDouble(20.0)];