С классом CSS, добавленным в строку, как рекомендовано в предыдущем ответе, вы можете применить следующий скрипт и стиль:
$(function () {
setInterval(flashRow, 500);
});
function flashRow() {
$("tr.blink").toggleClass("red");
}
Css стиль:
tr.blink
{
background-color: Green;
}
tr.red
{
background-color: Red;
}
Где мигает - стиль CSS, который вы добавляете в строку в методе RowDataBound.
См. Демо здесь