Как уже упоминалось в предыдущих постерах, после правильной установки APC будет "просто работать", сохраняя скомпилированный код PHP, чтобы сохранить это, что нужно делать каждый раз. Вам больше нечего делать.
Однако вы также можете использовать APC для хранения настроек, которые вы, возможно, ранее получили, например, из поиска в базе данных. Взгляните на apc_store и связанные с ним функции.