Ваша первая проблема заключается в том, что вы не можете запускать приложения в фоновом режиме так же, как на Mac.
Но, при условии, что достаточно просто запустить приложение, ответ таков: это зависит. Другое приложение должно было бы определить схему URL. К сожалению, не все. Тогда вы просто позвоните [UIApplication openURL:].