Я использую Windows Mobile 2005, Visual Studio 2008, приложение c ++ для интеллектуальных устройств.
Я использую getprofilestring, writeprofilestring (и аналогичные) для работы с настройками.Я использую файл .cab для установки приложения.
Решение состоит в том, чтобы создать отдельный проект установки и правильно указать все пути реестра ne.