Нет способа запретить пользователям управлять настройками прокси, которые будут работать во всех браузерах. Для IE и Chrome / Safari (которые зависят от настроек IE) вы можете установить групповую политику, чтобы запретить изменение настроек пользователем без прав администратора. (Тем не менее, Chrome может быть запущен с помощью командной строки, указывающей игнорировать настройки прокси-сервера системы).